Coronavirus: mutasi

dan Christiane Fux, editor perubatan Dikemas kini pada

Maximilian Reindl belajar kimia dan biokimia di LMU di Munich dan telah menjadi ahli pasukan editorial sejak Disember 2020. Dia akan membiasakan diri dengan topik perubatan, saintifik dan kesihatan untuk anda agar mereka dapat difahami dan difahami.

Lagi catatan oleh Maximilian Reindl

Christiane Fux belajar kewartawanan dan psikologi di Hamburg. Editor perubatan yang berpengalaman telah menulis artikel majalah, berita dan teks fakta mengenai semua topik kesihatan yang dapat difikirkan sejak tahun 2001. Selain bekerja untuk, Christiane Fux juga aktif dalam bidang prosa. Novel jenayah pertamanya diterbitkan pada tahun 2012, dan dia juga menulis, merancang dan menerbitkan drama jenayahnya sendiri.

Lagi kiriman oleh Christiane Fux Semua kandungan diperiksa oleh wartawan perubatan.

Pada masa ini, varian delta dari Sars-CoV-2 menjadi perhatian khusus bagi para pakar: Ia bukan hanya nampak lebih menular, tetapi juga lebih berbahaya daripada jenis liar yang asli. Mutasi lain terbukti paling tidak menular. Di sini anda dapat mengetahui sifat apa yang dimiliki oleh mutasi coronavirus yang berlainan, di mana ia merebak dan mengapa vaksinasi masih melindungi dengan baik.

Mutasi adalah perkara biasa

Kemunculan varian virus baru tidak biasa: Virus - termasuk patogen Sars-CoV-2 - berulang kali secara rawak mengubah bahan genetik mereka semasa replikasi. Sebilangan besar mutasi tersebut tidak bermakna. Tetapi ada yang bermanfaat untuk virus dan berlaku.

Dengan cara ini, virus dapat menyesuaikan diri dengan cepat dengan persekitaran dan inangnya. Ini adalah sebahagian daripada strategi evolusi mereka.

Namun, sementara itu, apa yang disebut "Varian of Concern" (VoC) telah muncul dengan Sars-CoV-2 - yaitu, varian yang menjadi perhatian para pakar. Kesamaan mereka ialah mereka lebih mudah menular daripada bentuk asli Sars-CoV-2.

Ini adalah empat varian berikut:

• Alpha: Garisan, juga dikenali sebagai B.1.1.7, tersebar dari Great Britain.
• Beta: Garisan, juga dikenali sebagai B.1.351, tersebar dari Afrika Selatan.
• Gamma: Garisan, juga dikenali sebagai P.1, tersebar dari Brazil.
• Delta: Garisan, juga dikenali sebagai B.1.617, tersebar dari India.

Variasi virus dikelompokkan menjadi kelompok atau baris yang disebut - penyelidik membuat sejenis "pohon keluarga coronavirus". Setiap varian dicirikan mengikut susunan genetiknya dan diberi kombinasi huruf dan angka. Sama ada strain virus yang lebih berbahaya atau tidak, tidak dapat ditentukan dari sebutan ini - ia hanya digunakan untuk rakaman dan dokumentasi yang sistematik.

By the way: Pertubuhan Kesihatan Sedunia (WHO) baru-baru ini mencadangkan memperkenalkan nama baru untuk varian Sars-CoV-2 yang paling penting. Menurut WHO, varian virus individu sekarang harus dinamakan dalam urutan menaik mengikut abjad Yunani.

Huraian baru, lebih sederhana dan, paling utama, neutral ini bertujuan untuk mengelakkan varian virus baru disamakan dengan lokasi pengesanan pertama mereka. Ini untuk mengelakkan stigmata, diskriminasi dan prasangka yang tidak berasas dan tidak berasas secara saintifik terhadap setiap negara dalam perbahasan awam.

Kemungkinan besar. Kajian dari Scotland yang diterbitkan dalam jurnal berprestij The Lancet menunjukkan bahawa risiko rawatan hospital untuk jangkitan dengan Delta dua kali lebih tinggi daripada varian asalnya.

Adakah vaksinasi melindungi terhadap varian Delta?

Ya. BioNTech / Pfizer melindungi 79 peratus daripada penyakit terhadap Delta setelah dos vaksinasi kedua berbanding 92 persen terhadap varian alpha, yang pada awalnya dikesan di Great Britain. Setelah vaksinasi dengan AstraZeneca, perlindungan selepas dos vaksinasi kedua adalah 60 peratus berbanding 73 peratus.

Angka-angka ini berkaitan dengan kursus simptomatik ringan dan sederhana. Seberapa baik perlindungan vaksinasi terhadap penyakit dan kematian yang teruk tidak diambil kira. Tetapi di sinilah penilaian perlindungan dapat menjadi jauh lebih baik.

Virus Delta - Fakta Imunologi

Varian delta coronavirus (B.1.617) pertama kali dijumpai di India. Ia menunjukkan tiga sub-varian dan menggabungkan beberapa perubahan ciri. Pengumpulan seperti itu ditunjukkan untuk pertama kalinya dalam varian virus.

Di satu pihak, ini adalah perubahan dalam protein lonjakan, yang dianggap sebagai "kunci" bagi sel manusia. Sebaliknya, B.1.617 juga menunjukkan perubahan yang dibincangkan sebagai (kemungkinan) mutasi melarikan diri.

Secara khusus, B.1.617 menggabungkan mutasi relevan berikut:

Mutasi D614G: Ini dapat menjadikan coronavirus lebih menular. Pemodelan awal menunjukkan bahawa B.1.617 dihantar sekurang-kurangnya semudah varian alpha yang sangat menular (B.1.1.7).

Mutasi T478K: Ini membawa kepada pertukaran threonine asid amino yang tidak dicas oleh lisin pada kedudukan 478, diprotonasikan dalam keadaan fisiologi - dan dengan itu dikenakan positif. Diasumsikan bahawa pertukaran asid amino ini mempengaruhi interaksi dengan reseptor ACE2. Pakar mengesyaki bahawa ini boleh mencetuskan penyakit Covid-19 yang lebih teruk.

Mutasi P681R: Penyelidik juga mengaitkannya dengan kemungkinan peningkatan virulensi.

Mutasi E484K: Juga terdapat dalam varian beta (B.1.351) dan varian gamma (P.1). Ia disyaki menjadikan virus ini kurang sensitif terhadap peneutralan antibodi yang telah terbentuk.

Mutasi L452R: Ia juga dibincangkan sebagai kemungkinan mutasi melarikan diri. Strain coronavirus dengan mutasi L452R sebagian tahan terhadap antibodi tertentu dalam eksperimen makmal.

Varian virus lain yang diketahui

Di samping itu, varian virus Sars-CoV-2 tambahan dikembangkan yang berbeza dari jenis liar - tetapi pakar tidak mengira mereka sebagai VOC. Strain virus ini disebut "Varian of Interest" (VOI) - iaitu, varian minat tertentu.

Masih belum jelas apa kesan VOI yang muncul ini terhadap pandemi. Sekiranya mereka menahan diri dari jenis virus yang sudah beredar, mereka juga boleh ditingkatkan ke VOC yang sesuai.

Varian minat tertentu

Menurut Pusat Pencegahan dan Pengendalian Penyakit Eropah (ECDC), VOI ini pada masa ini merangkumi:

• Eta: terbukti di banyak negara (B.1.525)
• Iota: pertama kali ditemui di Amerika Syarikat di kawasan New York (B.1.526)
• Kappa: pertama kali ditemui di India (B.1.617.1)
• Lambda: pertama kali ditemui di Peru (c.37)

Di samping itu, menurut ECDC, terdapat VOI lebih lanjut yang belum dijelaskan menurut nomenklatur WHO yang baru:

• B. 1.620 asal tidak diketahui.
• B. 1.621 pertama kali ditemui di Colombia.

Menurut maklumat dari ECDC dan WHO, varian yang disebutkan sebelumnya sebagai epsilon, zeta dan theta bukan lagi sebahagian daripada VOI. Varian B.1.616, yang terdeteksi untuk pertama kalinya di Perancis, juga beredar untuk waktu yang lama tanpa memberi kesan yang signifikan terhadap pandemi.

Varian di bawah pemerhatian

Apa yang disebut "Varian di bawah pemantauan" (VUM) juga dalam fokus yang diperluas - namun, masih terdapat kekurangan data sistematik yang boleh dipercayai. Selalunya, hanya ada bukti keberadaan mereka. Mereka termasuk varian yang berlaku secara sporadis atau "diubah" - atau lebih baik dikatakan, dikembangkan lebih lanjut - keturunan mutasi yang sudah diketahui.

Menurut ECDC, VUM yang jarang berlaku ini merangkumi:

• B.1.427 dan B.1.429 - sebelumnya disebut sebagai Epsilon oleh WHO, kini diturunkan, pertama kali ditemui di California.
• P.2 - sebelumnya disebut sebagai Zeta oleh WHO, kini diturunkan, pertama kali ditemui di Brazil.
• P.3 - sebelumnya disebut sebagai theta oleh WHO, kini diturunkan, pertama kali ditemui di Filipina.
• B.1.214.2, A.27, A.28, C.16 dan B.1.1.318 - varian asal tidak diketahui.
• Varian lain yang pertama kali dikesan di Afrika Selatan: B.1.351 + E516Q dan B.1.351 + P384L, C.1.2
• Varian lain yang pertama kali dikesan di Great Britain: B.1.1.7 + L452R dan B.1.1.7 + S494P, A.23.1 + E484K, AV.1, B.1.671.2 + K417N
• Varian lain yang pertama kali dikesan di AS: B.1.526.1, B.1.526.2
• Varian yang pertama kali dikesan di Rusia: AT.1
• Varian yang pertama kali dikesan di Mesir: C.36 + L452R
• Varian yang pertama kali dikesan di Mexico: B.1.1.519

Walaupun sebilangan besar varian virus baru sekarang diketahui, ini tidak secara automatik bermaksud ancaman yang lebih besar. Penilaian risiko belum dapat dilakukan pada masa ini. Pengaruh VUM ini pada proses jangkitan (global) juga tidak dapat diramalkan. Oleh itu, sama ada beberapa varian virus relevan atau berbahaya hanya dapat diperjelas dengan pemerhatian selanjutnya.

Seberapa berbahaya mutasi coronavirus?

Mutasi coronavirus secara rasmi diklasifikasikan sebagai "Varian of Concern" adalah, menurut pengetahuan semasa, lebih berbahaya daripada jenis coronavirus liar. Mereka sangat berjangkit dan perubahan yang sesuai (mutasi pelarian) dapat menyebabkan jangkitan sekunder.

Walau bagaimanapun, penilaian umum sama ada mutasi coronavirus lain lebih berbahaya daripada patogen Sars-CoV-2 yang asli tidak mudah dilakukan. Terdapat kekurangan pengalaman dan pangkalan data yang kukuh, terutama dengan varian yang baru muncul.

Apakah maksud kuasa menular yang lebih tinggi?

Sekiranya Sars-CoV-2 menjadi lebih mudah berjangkit, ia juga akan lebih sukar untuk menghentikan penyebarannya. Langkah-langkah yang sejauh ini berjaya membendung penyebaran mungkin tidak lagi mencukupi.

Jika, misalnya, nilai replikasi R untuk bentuk liar virus dikurangkan menjadi 0.8 dan jumlah orang yang dijangkiti dikurangkan secara beransur-ansur, virus yang sekitar 35 persen lebih menular akan merebak lebih jauh dan menggerakkan rantai jangkitan jika langkah yang sama telah diambil.

Apakah maksud vaksin ini?

Tidak ada jawapan umum untuk ini. Kemungkinan kesan pelindung dari vaksin yang baru dikembangkan dibincangkan secara mendalam di kalangan pakar. Sejauh ini, pengeluar vaksin dan siasatan awal telah memberikan semua yang jelas dalam hal ini.

Sebagai contoh, Comirnaty menunjukkan dalam kajian awal keberkesanan yang setanding dengan varian alpha (B.1.1.7) dan varian beta (B.1.351). VaxZevria juga nampaknya memberikan perlindungan yang baik di B.1.1.7, tetapi keberkesanannya terhadap garis B.1.351 dapat dikurangkan.

Sejauh mana vaksin lain dari Moderna dan Johnson & Johnson akan bertahan terhadap varian virus yang diubah belum dapat dijelaskan secara meyakinkan.

Ketika virus itu berkembang, penyesuaian vaksin mungkin diperlukan. Namun, kerana kemajuan dalam pengembangan vaksin, ini dapat dilakukan dalam jangka waktu yang singkat. Walau bagaimanapun, semua vaksin yang diluluskan di Kesatuan Eropah masih memberikan perlindungan yang berkesan dan mencukupi - terutamanya terhadap kursus Covid-19 yang teruk dan membawa maut.

Maklumat lebih lanjut mengenai subjek vaksin coronavirus boleh didapati di sini.

Seberapa cepat Sars-CoV-2 bermutasi?

Di masa depan, Sars-CoV-2 akan terus menyesuaikan diri dengan sistem kekebalan tubuh manusia dan kepada (sebahagian) populasi yang divaksinasi melalui mutasi. Seberapa cepat kejadian ini banyak bergantung pada ukuran populasi yang dijangkiti secara aktif.

Semakin banyak kes jangkitan - serantau, nasional, dan antarabangsa - semakin banyak coronavirus berkembang biak - dan semakin kerap berlaku mutasi.

Namun, berbanding dengan virus lain, coronavirus bermutasi secara perlahan. Dengan panjang genom Sars-CoV-2 sekitar 30,000 pasangan asas, pakar menganggap satu hingga dua mutasi sebulan. Sebagai perbandingan: Virus influenza bermutasi dua hingga empat kali lebih kerap dalam tempoh yang sama.

Bagaimana saya dapat melindungi diri daripada mutasi coronavirus?

Anda secara khusus tidak dapat melindungi diri anda daripada mutasi coronavirus individu - satu-satunya pilihan adalah tidak dijangkiti.

Sebagai peraturan umum, patuhi peraturan kebersihan, jaga jarak dan pakai topeng FFP2 anda di khalayak ramai. Sekiranya anda mendapat vaksin, anda juga akan menikmati imuniti asas yang baik terhadap kursus yang teruk.

Bagaimana mutasi coronavirus ditemui?

Jerman mempunyai sistem pelaporan erat untuk memantau virus Sars-CoV-2 yang beredar - ia disebut "sistem pengawasan molekul bersepadu". Untuk tujuan ini, pihak berkuasa kesihatan yang berkaitan, Institut Robert Koch (RKI), makmal diagnostik khusus dan makmal perundingan untuk coronavirus di Berlin Charité bekerjasama.

Bagaimanakah sistem pelaporan berfungsi jika terdapat dugaan mutasi?

Pertama sekali, setiap ujian koronavirus positif yang dilakukan secara profesional diminta untuk melaporkan kepada pihak kesihatan yang bertanggungjawab.Ini termasuk ujian coronavirus yang dilakukan di pusat ujian, di doktor, di farmasi atau di kemudahan kerajaan - seperti sekolah. Walau bagaimanapun, ujian kendiri persendirian tidak termasuk dalam ini.

Maklumat lebih lanjut mengenai ujian cepat coronavirus untuk kegunaan peribadi boleh didapati dalam topik ujian diri Corona khas kami.

Sekiranya hasilnya positif, doktor akan menghantar sampel pesakit yang sesuai ke makmal diagnostik khusus, yang mengesahkan hasilnya menggunakan ujian PCR. Sekiranya ujian PCR juga positif - sampel juga dapat dihantar ke makmal penjujukan di mana ia dapat diperiksa lebih lanjut (analisis genom penjujukan).

RKI kemudian membandingkan data pelaporan dan hasil analisis urutan dengan nama samaran. Nama samaran bermaksud bahawa tidak mungkin membuat kesimpulan mengenai satu orang. Walau bagaimanapun, maklumat ini menjadi asas data bagi para saintis dan pihak berkepentingan dalam sistem penjagaan kesihatan untuk mendapatkan gambaran yang tepat mengenai keadaan pandemik semasa. Ini memungkinkan penilaian keadaan sebaik mungkin untuk (jika perlu) mengambil langkah politik.

Apakah analisis genom penjujukan?

Analisis genom penjujukan adalah analisis genetik terperinci. Dia memeriksa urutan tepat komponen RNA individu dalam genom virus. Ini bermaksud bahawa genom Sars-CoV-2, yang terdiri daripada sekitar 30,000 pasangan asas, diuraikan dan kemudian dapat dibandingkan dengan jenis liar coronavirus.

Hanya dengan cara ini mutasi individu dapat dikenali pada tahap molekul - dan kemungkinan dilakukan dalam "pohon keluarga coronavirus".

Penjujukan genom adalah proses yang memakan masa dan mahal dengan kapasiti (sangat) terhad. Jadi tidak setiap sampel positif dapat disusun secara rutin. Pakar membuat pemilihan awal - jadi mereka mengambil sampel.

Ini juga menjelaskan bahawa tidak setiap negara di dunia dapat mengesan penyebaran tepat varian coronavirus tertentu secara terperinci. Oleh itu, kemungkinan terdapat kekurangan yang jelas dalam data pelaporan yang ada.

Tags.:  tekanan ubat paliatif temu ramah